Protein–RNA interactions for Protein: O70274

Ptp4a2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a2O70274 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptp4a2O70274 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ptp4a2O70274 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptp4a2O70274 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptp4a2O70274 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptp4a2O70274 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptp4a2O70274 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ptp4a2O70274 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptp4a2O70274 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptp4a2O70274 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptp4a2O70274 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptp4a2O70274 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptp4a2O70274 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptp4a2O70274 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptp4a2O70274 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptp4a2O70274 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptp4a2O70274 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptp4a2O70274 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptp4a2O70274 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptp4a2O70274 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ptp4a2O70274 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptp4a2O70274 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptp4a2O70274 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptp4a2O70274 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptp4a2O70274 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ptp4a2O70274 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ptp4a2O70274 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ptp4a2O70274 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptp4a2O70274 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptp4a2O70274 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptp4a2O70274 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptp4a2O70274 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptp4a2O70274 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ptp4a2O70274 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptp4a2O70274 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptp4a2O70274 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptp4a2O70274 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptp4a2O70274 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ptp4a2O70274 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms