Protein–RNA interactions for Protein: O70228

Atp9a, Probable phospholipid-transporting ATPase IIA, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9aO70228 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atp9aO70228 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atp9aO70228 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atp9aO70228 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms