Protein–RNA interactions for Protein: O70220

Foxq1, Forkhead box protein Q1, mousemouse

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Length 400 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxq1O70220 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Foxq1O70220 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Foxq1O70220 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxq1O70220 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxq1O70220 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxq1O70220 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxq1O70220 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxq1O70220 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxq1O70220 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxq1O70220 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxq1O70220 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxq1O70220 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxq1O70220 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxq1O70220 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxq1O70220 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Foxq1O70220 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxq1O70220 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxq1O70220 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxq1O70220 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxq1O70220 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxq1O70220 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Foxq1O70220 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxq1O70220 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxq1O70220 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxq1O70220 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxq1O70220 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxq1O70220 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxq1O70220 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxq1O70220 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Foxq1O70220 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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