Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chrna4O70174 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Chrna4O70174 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms