Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cbx4O55187 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cbx4O55187 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cbx4O55187 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cbx4O55187 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx4O55187 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx4O55187 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx4O55187 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx4O55187 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx4O55187 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx4O55187 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx4O55187 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx4O55187 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx4O55187 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cbx4O55187 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx4O55187 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx4O55187 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx4O55187 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx4O55187 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx4O55187 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx4O55187 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx4O55187 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx4O55187 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx4O55187 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cbx4O55187 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx4O55187 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx4O55187 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx4O55187 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx4O55187 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx4O55187 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx4O55187 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Cbx4O55187 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms