Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cyp26a1O55127 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cyp26a1O55127 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cyp26a1O55127 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms