Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nipsnap2O55126 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nipsnap2O55126 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms