Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Syngr2O55101 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Syngr2O55101 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms