Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Syngr1O55100 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Syngr1O55100 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Syngr1O55100 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms