Protein–RNA interactions for Protein: O54990

Prom1, Prominin-1, mousemouse

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom1O54990 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prom1O54990 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prom1O54990 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prom1O54990 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prom1O54990 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prom1O54990 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prom1O54990 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prom1O54990 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prom1O54990 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prom1O54990 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms