Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SlkO54988 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SlkO54988 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SlkO54988 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SlkO54988 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SlkO54988 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SlkO54988 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SlkO54988 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SlkO54988 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SlkO54988 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SlkO54988 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SlkO54988 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SlkO54988 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SlkO54988 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SlkO54988 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SlkO54988 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SlkO54988 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SlkO54988 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SlkO54988 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SlkO54988 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SlkO54988 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SlkO54988 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SlkO54988 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SlkO54988 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SlkO54988 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SlkO54988 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SlkO54988 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SlkO54988 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SlkO54988 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SlkO54988 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SlkO54988 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SlkO54988 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SlkO54988 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SlkO54988 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SlkO54988 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SlkO54988 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SlkO54988 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SlkO54988 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SlkO54988 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SlkO54988 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SlkO54988 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SlkO54988 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SlkO54988 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SlkO54988 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SlkO54988 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SlkO54988 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SlkO54988 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SlkO54988 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SlkO54988 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SlkO54988 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SlkO54988 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SlkO54988 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SlkO54988 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SlkO54988 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SlkO54988 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SlkO54988 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SlkO54988 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SlkO54988 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SlkO54988 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SlkO54988 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SlkO54988 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SlkO54988 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SlkO54988 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SlkO54988 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SlkO54988 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SlkO54988 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SlkO54988 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SlkO54988 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SlkO54988 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SlkO54988 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SlkO54988 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SlkO54988 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SlkO54988 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SlkO54988 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SlkO54988 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SlkO54988 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SlkO54988 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SlkO54988 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SlkO54988 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SlkO54988 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SlkO54988 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SlkO54988 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SlkO54988 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SlkO54988 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SlkO54988 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SlkO54988 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SlkO54988 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SlkO54988 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SlkO54988 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SlkO54988 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SlkO54988 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SlkO54988 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SlkO54988 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SlkO54988 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SlkO54988 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SlkO54988 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SlkO54988 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SlkO54988 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SlkO54988 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SlkO54988 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms