Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NlkO54949 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NlkO54949 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NlkO54949 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NlkO54949 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NlkO54949 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NlkO54949 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NlkO54949 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NlkO54949 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NlkO54949 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NlkO54949 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NlkO54949 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NlkO54949 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NlkO54949 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NlkO54949 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NlkO54949 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NlkO54949 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NlkO54949 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NlkO54949 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NlkO54949 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NlkO54949 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NlkO54949 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NlkO54949 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NlkO54949 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NlkO54949 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NlkO54949 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NlkO54949 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NlkO54949 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NlkO54949 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NlkO54949 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NlkO54949 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NlkO54949 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NlkO54949 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NlkO54949 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NlkO54949 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NlkO54949 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NlkO54949 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NlkO54949 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NlkO54949 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NlkO54949 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NlkO54949 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NlkO54949 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NlkO54949 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NlkO54949 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NlkO54949 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NlkO54949 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NlkO54949 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NlkO54949 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NlkO54949 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NlkO54949 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NlkO54949 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NlkO54949 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NlkO54949 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NlkO54949 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NlkO54949 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NlkO54949 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NlkO54949 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NlkO54949 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NlkO54949 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NlkO54949 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NlkO54949 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NlkO54949 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NlkO54949 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NlkO54949 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NlkO54949 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NlkO54949 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NlkO54949 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NlkO54949 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NlkO54949 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NlkO54949 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NlkO54949 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NlkO54949 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NlkO54949 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NlkO54949 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NlkO54949 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NlkO54949 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NlkO54949 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NlkO54949 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NlkO54949 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NlkO54949 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NlkO54949 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NlkO54949 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NlkO54949 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NlkO54949 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NlkO54949 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NlkO54949 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NlkO54949 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NlkO54949 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NlkO54949 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NlkO54949 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NlkO54949 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NlkO54949 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NlkO54949 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NlkO54949 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NlkO54949 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NlkO54949 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NlkO54949 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NlkO54949 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NlkO54949 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NlkO54949 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms