Protein–RNA interactions for Protein: O54915

Nr1i2, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1i2O54915 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1i2O54915 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Nr1i2O54915 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nr1i2O54915 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms