Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CrxO54751 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CrxO54751 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CrxO54751 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CrxO54751 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxO54751 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxO54751 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxO54751 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxO54751 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxO54751 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxO54751 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxO54751 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxO54751 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxO54751 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxO54751 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxO54751 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxO54751 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxO54751 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxO54751 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxO54751 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxO54751 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxO54751 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxO54751 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxO54751 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxO54751 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxO54751 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CrxO54751 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxO54751 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxO54751 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxO54751 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxO54751 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxO54751 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxO54751 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxO54751 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxO54751 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxO54751 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CrxO54751 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxO54751 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxO54751 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxO54751 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxO54751 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxO54751 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxO54751 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxO54751 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxO54751 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxO54751 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxO54751 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxO54751 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxO54751 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxO54751 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxO54751 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxO54751 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxO54751 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxO54751 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxO54751 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CrxO54751 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CrxO54751 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CrxO54751 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CrxO54751 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CrxO54751 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CrxO54751 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CrxO54751 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CrxO54751 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CrxO54751 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CrxO54751 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CrxO54751 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CrxO54751 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CrxO54751 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CrxO54751 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CrxO54751 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxO54751 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxO54751 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxO54751 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxO54751 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxO54751 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxO54751 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxO54751 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxO54751 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxO54751 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxO54751 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxO54751 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxO54751 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxO54751 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CrxO54751 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxO54751 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxO54751 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxO54751 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxO54751 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxO54751 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxO54751 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxO54751 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CrxO54751 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxO54751 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxO54751 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxO54751 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxO54751 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxO54751 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxO54751 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxO54751 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CrxO54751 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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