Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cavin1O54724 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cavin1O54724 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cavin1O54724 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms