Protein–RNA interactions for Protein: O54689

Ccr6, C-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr6O54689 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccr6O54689 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccr6O54689 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr6O54689 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms