Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf9O35739 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Klf9O35739 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf9O35739 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf9O35739 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf9O35739 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Klf9O35739 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf9O35739 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Klf9O35739 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms