Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ppfibp2O35711 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ppfibp2O35711 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ppfibp2O35711 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ppfibp2O35711 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms