Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag2O35638 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stag2O35638 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stag2O35638 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stag2O35638 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stag2O35638 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stag2O35638 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stag2O35638 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stag2O35638 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stag2O35638 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Stag2O35638 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stag2O35638 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stag2O35638 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stag2O35638 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stag2O35638 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stag2O35638 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms