Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Opn1mwO35599 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Opn1mwO35599 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Opn1mwO35599 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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