Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Stx1aO35526 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx1aO35526 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms