Protein–RNA interactions for Protein: O35516

Notch2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch2O35516 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Notch2O35516 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Notch2O35516 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Notch2O35516 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Notch2O35516 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Notch2O35516 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Notch2O35516 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Notch2O35516 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Notch2O35516 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Notch2O35516 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Notch2O35516 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Notch2O35516 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Notch2O35516 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Notch2O35516 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Notch2O35516 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Notch2O35516 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Notch2O35516 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Notch2O35516 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Notch2O35516 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Notch2O35516 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Notch2O35516 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Notch2O35516 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Notch2O35516 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Notch2O35516 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Notch2O35516 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Notch2O35516 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Notch2O35516 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Notch2O35516 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Notch2O35516 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Notch2O35516 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Notch2O35516 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Notch2O35516 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Notch2O35516 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Notch2O35516 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Notch2O35516 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Notch2O35516 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Notch2O35516 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Notch2O35516 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Notch2O35516 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Notch2O35516 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Notch2O35516 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Notch2O35516 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Notch2O35516 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Notch2O35516 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Notch2O35516 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms