Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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Ptpn9O35239 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
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Ptpn9O35239 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Ptpn9O35239 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptpn9O35239 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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Ptpn9O35239 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptpn9O35239 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptpn9O35239 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Ptpn9O35239 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptpn9O35239 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptpn9O35239 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptpn9O35239 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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Ptpn9O35239 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ptpn9O35239 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ptpn9O35239 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ptpn9O35239 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ptpn9O35239 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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Ptpn9O35239 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Ptpn9O35239 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptpn9O35239 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Ptpn9O35239 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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Ptpn9O35239 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptpn9O35239 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptpn9O35239 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptpn9O35239 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptpn9O35239 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptpn9O35239 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptpn9O35239 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptpn9O35239 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptpn9O35239 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptpn9O35239 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Ptpn9O35239 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptpn9O35239 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptpn9O35239 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptpn9O35239 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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Ptpn9O35239 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms