Protein–RNA interactions for Protein: O35235

Tnfsf11, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf11O35235 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tnfsf11O35235 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsf11O35235 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms