Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ebi3O35228 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ebi3O35228 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms