Protein–RNA interactions for Protein: O09126

Sema4d, Semaphorin-4D, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4dO09126 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema4dO09126 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4dO09126 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4dO09126 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4dO09126 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4dO09126 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4dO09126 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4dO09126 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4dO09126 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4dO09126 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4dO09126 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4dO09126 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4dO09126 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4dO09126 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4dO09126 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4dO09126 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema4dO09126 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema4dO09126 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema4dO09126 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema4dO09126 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema4dO09126 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema4dO09126 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema4dO09126 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema4dO09126 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema4dO09126 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema4dO09126 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema4dO09126 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sema4dO09126 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sema4dO09126 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms