Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sypl1O09117 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sypl1O09117 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sypl1O09117 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sypl1O09117 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sypl1O09117 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sypl1O09117 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sypl1O09117 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sypl1O09117 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sypl1O09117 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sypl1O09117 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sypl1O09117 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sypl1O09117 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sypl1O09117 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sypl1O09117 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sypl1O09117 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sypl1O09117 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sypl1O09117 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sypl1O09117 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Sypl1O09117 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sypl1O09117 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sypl1O09117 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sypl1O09117 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sypl1O09117 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sypl1O09117 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sypl1O09117 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sypl1O09117 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms