Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Barx2O08686 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Barx2O08686 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Barx2O08686 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Barx2O08686 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Barx2O08686 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Barx2O08686 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Barx2O08686 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Barx2O08686 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Barx2O08686 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms