Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm20939L7N243 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm20939L7N243 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm20939L7N243 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms