Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

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Length 857 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn2r88L7N1W8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn2r88L7N1W8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn2r88L7N1W8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmn2r88L7N1W8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn2r88L7N1W8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn2r88L7N1W8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn2r88L7N1W8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn2r88L7N1W8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn2r88L7N1W8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn2r88L7N1W8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn2r88L7N1W8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn2r88L7N1W8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn2r88L7N1W8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn2r88L7N1W8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn2r88L7N1W8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn2r88L7N1W8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn2r88L7N1W8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn2r88L7N1W8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn2r88L7N1W8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmn2r88L7N1W8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Vmn2r88L7N1W8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Vmn2r88L7N1W8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmn2r88L7N1W8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmn2r88L7N1W8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmn2r88L7N1W8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmn2r88L7N1W8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmn2r88L7N1W8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmn2r88L7N1W8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn2r88L7N1W8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmn2r88L7N1W8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn2r88L7N1W8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn2r88L7N1W8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn2r88L7N1W8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn2r88L7N1W8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn2r88L7N1W8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn2r88L7N1W8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmn2r88L7N1W8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn2r88L7N1W8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn2r88L7N1W8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn2r88L7N1W8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn2r88L7N1W8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmn2r88L7N1W8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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