Protein–RNA interactions for Protein: K7N5P2

Gm3402, Predicted gene 3402, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3402K7N5P2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3402K7N5P2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3402K7N5P2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms