Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ32

A630076J17Rik, MCG1026332, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A630076J17RikJ3QQ32 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
A630076J17RikJ3QQ32 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
A630076J17RikJ3QQ32 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms