Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Gm2056J3QQ02 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm2056J3QQ02 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms