Protein–RNA interactions for Protein: J3QNR8

Trim34b, Tripartite motif-containing 34B, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim34bJ3QNR8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim34bJ3QNR8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Trim34bJ3QNR8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim34bJ3QNR8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim34bJ3QNR8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim34bJ3QNR8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim34bJ3QNR8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim34bJ3QNR8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms