Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm20918J3QN17 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm20918J3QN17 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms