Protein–RNA interactions for Protein: J3QMW1

Gm7137, MCG1044197, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7137J3QMW1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm7137J3QMW1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm7137J3QMW1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm7137J3QMW1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm7137J3QMW1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7137J3QMW1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7137J3QMW1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7137J3QMW1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7137J3QMW1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7137J3QMW1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7137J3QMW1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7137J3QMW1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7137J3QMW1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7137J3QMW1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7137J3QMW1 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7137J3QMW1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7137J3QMW1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7137J3QMW1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7137J3QMW1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7137J3QMW1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm7137J3QMW1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm7137J3QMW1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7137J3QMW1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7137J3QMW1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm7137J3QMW1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7137J3QMW1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7137J3QMW1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7137J3QMW1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7137J3QMW1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7137J3QMW1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7137J3QMW1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7137J3QMW1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7137J3QMW1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7137J3QMW1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7137J3QMW1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7137J3QMW1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7137J3QMW1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7137J3QMW1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm7137J3QMW1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7137J3QMW1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7137J3QMW1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7137J3QMW1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7137J3QMW1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7137J3QMW1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm7137J3QMW1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7137J3QMW1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7137J3QMW1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7137J3QMW1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7137J3QMW1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm7137J3QMW1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm7137J3QMW1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm7137J3QMW1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms