Protein–RNA interactions for Protein: J3QK59

Gm6176, Predicted gene 6176, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm6176J3QK59 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6176J3QK59 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6176J3QK59 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm6176J3QK59 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6176J3QK59 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm6176J3QK59 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm6176J3QK59 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm6176J3QK59 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm6176J3QK59 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm6176J3QK59 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6176J3QK59 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6176J3QK59 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6176J3QK59 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6176J3QK59 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6176J3QK59 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6176J3QK59 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6176J3QK59 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6176J3QK59 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm6176J3QK59 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6176J3QK59 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm6176J3QK59 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm6176J3QK59 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Gm6176J3QK59 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm6176J3QK59 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm6176J3QK59 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm6176J3QK59 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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