Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20830J3KML6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm20830J3KML6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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