Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Pot1bH7BX60 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pot1bH7BX60 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms