Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rnf148G3X9R7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rnf148G3X9R7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rnf148G3X9R7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms