Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pnmal2G3X9N3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pnmal2G3X9N3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Pnmal2G3X9N3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pnmal2G3X9N3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pnmal2G3X9N3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pnmal2G3X9N3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pnmal2G3X9N3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pnmal2G3X9N3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pnmal2G3X9N3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pnmal2G3X9N3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pnmal2G3X9N3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Pnmal2G3X9N3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pnmal2G3X9N3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pnmal2G3X9N3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Pnmal2G3X9N3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pnmal2G3X9N3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pnmal2G3X9N3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pnmal2G3X9N3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pnmal2G3X9N3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pnmal2G3X9N3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pnmal2G3X9N3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pnmal2G3X9N3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pnmal2G3X9N3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Pnmal2G3X9N3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms