Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chrna9G3X8Z7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Chrna9G3X8Z7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Chrna9G3X8Z7 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms