Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmigd3G3X8R9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmigd3G3X8R9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmigd3G3X8R9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms