Protein–RNA interactions for Protein: G3UXE9

Gm8909, Predicted gene 8909, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8909G3UXE9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm8909G3UXE9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Gm8909G3UXE9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gm8909G3UXE9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms