Protein–RNA interactions for Protein: G3UW56

Vmn2r85, MCG21565, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r85G3UW56 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r85G3UW56 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r85G3UW56 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r85G3UW56 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r85G3UW56 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r85G3UW56 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn2r85G3UW56 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Vmn2r85G3UW56 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Vmn2r85G3UW56 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn2r85G3UW56 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn2r85G3UW56 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn2r85G3UW56 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Vmn2r85G3UW56 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r85G3UW56 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r85G3UW56 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r85G3UW56 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r85G3UW56 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r85G3UW56 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r85G3UW56 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r85G3UW56 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r85G3UW56 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmn2r85G3UW56 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn2r85G3UW56 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn2r85G3UW56 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn2r85G3UW56 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmn2r85G3UW56 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms