Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vmn1r76F8VQ63 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmn1r76F8VQ63 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms