Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Ercc6F8VPZ5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Ercc6F8VPZ5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Ercc6F8VPZ5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Ercc6F8VPZ5 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Ercc6F8VPZ5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ercc6F8VPZ5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ercc6F8VPZ5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ercc6F8VPZ5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ercc6F8VPZ5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ercc6F8VPZ5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ercc6F8VPZ5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ercc6F8VPZ5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ercc6F8VPZ5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ercc6F8VPZ5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Ercc6F8VPZ5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ercc6F8VPZ5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Ercc6F8VPZ5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ercc6F8VPZ5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ercc6F8VPZ5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ercc6F8VPZ5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ercc6F8VPZ5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Ercc6F8VPZ5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ercc6F8VPZ5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ercc6F8VPZ5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ercc6F8VPZ5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Ercc6F8VPZ5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ercc6F8VPZ5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ercc6F8VPZ5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Ercc6F8VPZ5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Ercc6F8VPZ5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
Ercc6F8VPZ5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ercc6F8VPZ5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ercc6F8VPZ5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Ercc6F8VPZ5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ercc6F8VPZ5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ercc6F8VPZ5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ercc6F8VPZ5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Ercc6F8VPZ5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ercc6F8VPZ5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ercc6F8VPZ5 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ercc6F8VPZ5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ercc6F8VPZ5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ercc6F8VPZ5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Ercc6F8VPZ5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ercc6F8VPZ5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ercc6F8VPZ5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ercc6F8VPZ5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Ercc6F8VPZ5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Ercc6F8VPZ5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Ercc6F8VPZ5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Ercc6F8VPZ5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Ercc6F8VPZ5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Ercc6F8VPZ5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Ercc6F8VPZ5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Ercc6F8VPZ5 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Ercc6F8VPZ5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
Ercc6F8VPZ5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ercc6F8VPZ5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Ercc6F8VPZ5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Ercc6F8VPZ5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Ercc6F8VPZ5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Ercc6F8VPZ5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
Ercc6F8VPZ5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Ercc6F8VPZ5 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Ercc6F8VPZ5 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Ercc6F8VPZ5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Ercc6F8VPZ5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Ercc6F8VPZ5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Ercc6F8VPZ5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Ercc6F8VPZ5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Ercc6F8VPZ5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Ercc6F8VPZ5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Ercc6F8VPZ5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Ercc6F8VPZ5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ercc6F8VPZ5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ercc6F8VPZ5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ercc6F8VPZ5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ercc6F8VPZ5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ercc6F8VPZ5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Ercc6F8VPZ5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Ercc6F8VPZ5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Ercc6F8VPZ5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Ercc6F8VPZ5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Ercc6F8VPZ5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Ercc6F8VPZ5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Ercc6F8VPZ5 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Ercc6F8VPZ5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Ercc6F8VPZ5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Ercc6F8VPZ5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Ercc6F8VPZ5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ercc6F8VPZ5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ercc6F8VPZ5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ercc6F8VPZ5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Ercc6F8VPZ5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms