Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Speer4aF8VPX6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Speer4aF8VPX6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms