Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Herc6F2Z461 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Herc6F2Z461 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms