Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
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Rnf165E9QAU8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rnf165E9QAU8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf165E9QAU8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf165E9QAU8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf165E9QAU8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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Rnf165E9QAU8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf165E9QAU8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf165E9QAU8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf165E9QAU8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf165E9QAU8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf165E9QAU8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rnf165E9QAU8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
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Rnf165E9QAU8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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Rnf165E9QAU8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnf165E9QAU8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Rnf165E9QAU8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rnf165E9QAU8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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Rnf165E9QAU8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rnf165E9QAU8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Rnf165E9QAU8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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Rnf165E9QAU8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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Rnf165E9QAU8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
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Rnf165E9QAU8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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Rnf165E9QAU8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf165E9QAU8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Rnf165E9QAU8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rnf165E9QAU8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Rnf165E9QAU8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf165E9QAU8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf165E9QAU8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf165E9QAU8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf165E9QAU8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf165E9QAU8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf165E9QAU8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf165E9QAU8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf165E9QAU8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf165E9QAU8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf165E9QAU8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rnf165E9QAU8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf165E9QAU8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf165E9QAU8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf165E9QAU8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf165E9QAU8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf165E9QAU8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rnf165E9QAU8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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